Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms