Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms