Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CLIP1P30622 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms