Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHC1P29353 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHC1P29353 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHC1P29353 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms