Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAP3P28838 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAP3P28838 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAP3P28838 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAP3P28838 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAP3P28838 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAP3P28838 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAP3P28838 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAP3P28838 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAP3P28838 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAP3P28838 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAP3P28838 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAP3P28838 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAP3P28838 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms