Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GIFP27352 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIFP27352 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GIFP27352 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIFP27352 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIFP27352 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIFP27352 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIFP27352 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIFP27352 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIFP27352 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIFP27352 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIFP27352 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIFP27352 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIFP27352 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIFP27352 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIFP27352 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIFP27352 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIFP27352 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIFP27352 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIFP27352 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIFP27352 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIFP27352 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIFP27352 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIFP27352 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms