Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PLNP26678 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PLNP26678 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PLNP26678 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PLNP26678 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PLNP26678 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PLNP26678 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PLNP26678 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PLNP26678 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PLNP26678 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PLNP26678 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PLNP26678 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms