Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMLP26374 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMLP26374 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMLP26374 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMLP26374 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMLP26374 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMLP26374 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMLP26374 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMLP26374 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMLP26374 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMLP26374 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMLP26374 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMLP26374 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMLP26374 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMLP26374 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms