Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO2P25791 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO2P25791 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO2P25791 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO2P25791 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO2P25791 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO2P25791 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms