Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms