Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USF1P22415 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USF1P22415 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USF1P22415 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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