Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms