Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF3P17036 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms