Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms