Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME1P15531 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME1P15531 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME1P15531 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NME1P15531 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME1P15531 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME1P15531 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME1P15531 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME1P15531 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NME1P15531 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME1P15531 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME1P15531 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME1P15531 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME1P15531 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME1P15531 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME1P15531 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME1P15531 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NME1P15531 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NME1P15531 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms