Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRF1P14222 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRF1P14222 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms