Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms