Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms