Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms