Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHGAP10645 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHGAP10645 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHGAP10645 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHGAP10645 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHGAP10645 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHGAP10645 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHGAP10645 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHGAP10645 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHGAP10645 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHGAP10645 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHGAP10645 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHGAP10645 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHGAP10645 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHGAP10645 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHGAP10645 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHGAP10645 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHGAP10645 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHGAP10645 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHGAP10645 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHGAP10645 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHGAP10645 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHGAP10645 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms