Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms