Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms