Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3P09919 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3P09919 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSF3P09919 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CSF3P09919 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms