Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB7P09629 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms