Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MSMBP08118 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MSMBP08118 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MSMBP08118 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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MSMBP08118 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MSMBP08118 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSMBP08118 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSMBP08118 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSMBP08118 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSMBP08118 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSMBP08118 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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MSMBP08118 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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MSMBP08118 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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MSMBP08118 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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MSMBP08118 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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