Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms