Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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