Protein–RNA interactions for Protein: O95255

ABCC6, Multidrug resistance-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC6O95255 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC6O95255 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC6O95255 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms