Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F6O75461 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F6O75461 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F6O75461 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F6O75461 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F6O75461 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F6O75461 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F6O75461 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F6O75461 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F6O75461 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F6O75461 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F6O75461 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F6O75461 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F6O75461 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F6O75461 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F6O75461 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms