Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSO75390 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSO75390 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSO75390 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms