Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM4AO75164 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms