Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms