Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DENRO43583 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DENRO43583 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms