Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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