Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms