Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms