Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

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Length 775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3EO15041 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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