Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms