Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOR1AO14656 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms