Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms