Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISM1B1AKI9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms