Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms