Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC69A6NI79 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC69A6NI79 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms