Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EFCAB5A4FU69 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFCAB5A4FU69 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms