Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAMEF22A3QJZ6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF22A3QJZ6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms