Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y608

LRRFIP2, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP2Q9Y608 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRFIP2Q9Y608 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms