Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms