Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms