Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms