Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms